Större delen av Huddinge kommun ingår i Tyresåns sjösystem och avrinner österut till Kalvfjärden i Östersjön. Inom sjösystemet finns knappt 40 sjöar.

Huddinges västra del ingår i Mälarens sjösystem. Mälaren som i sin tur mynnar till Östersjön.

Därutöver finns i Huddinge den lilla sjön Holmträsket som avrinner mot Kagghamraån och sjöarna Öran och Långsjön i Hanveden som tillhör Vitsåns sjösystem.

Läs mer om Tyresåns sjösystem