Kommunen är en politiskt styrd organisation. I kommunfullmäktige, kommunstyrelse och i nämnderna sitter valda politiker som beslutar om kommunens verksamheter.

För varje nämnd finns en förvaltning med kommunanställda. Huddinge kommun har ca 6 000 anställda.

Räddningsverksamheten i kommunen sköts av Södertörns brandförsvarsförbund, vatten och avlopp av Stockholm Vatten AB, sophämtning och annan renhållning av SRV Återvinning AB.
Huge Fastigheter AB äger och förvaltar bostäder och fastigheter med lokaler för Huddinge kommuns olika verksamheter.